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CMakeに関する世界観です。
Autotoolsは多くのオープンソースプロジェクトで採用されていますが、古くなってきたため一部では新しいCMakeを使うこともあります。
以下の記事は、Plamo Linux開発者のこじまみつひろ氏によるAutotoolsやCMakeなどのビルドツールの解説であり、参考になります。
Autotoolsも参照のこと。
CMakeはKDEで使われている。KDEも参照のこと。
Makeを参照のこと。